Preview

Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции

Расширенный поиск

БЕЛКОВЫЕ МАРКЕРЫ, МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ И СЕЛЕКЦИОННЫЕ ПРИЗНАКИ В ИДЕНТИФИКАЦИИ ДУБЛЕТНЫХ ОБРАЗЦОВ КУЛЬТУРНОГО ОВСА В КОЛЛЕКЦИЯХ ВИР (РОССИЯ) И НОРДИЧЕСКОГО ГЕННОГО БАНКА (NORDGEN, ШВЕЦИЯ)

https://doi.org/10.30901/2227-8834-2016-3-82-93

Полный текст:

Аннотация

Обсуждаются методы идентификации дублетов в коллекциях генбанков и само понятие «дублетный образец». Представлены результаты сравнительного полевого и лабораторного анализа 112 пар потенциальных дублетных образцов овса из коллекций ВИР и NordGen. Установленное соответствие результатов полевого и лабораторного изучения подтверждает возможность использования электрофоретических спектров авенина для идентификации дублетных образцов в коллекциях овса посевного еще до полевых испытаний или в случае потери всхожести семян анализируемых образцов.

Об авторах

И. Н. Перчук
Федеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова
Россия


А. В. Конарев
Федеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова
Россия


И. Г. Лоскутов
Федеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова; Санкт-Петербургский государственный университет (СПбГУ)
Россия


Е. В. Блинова
Федеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова
Россия


Л. Ю. Новикова
Федеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова
Россия


В. И. Хорева
Федеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова
Россия


А. . Колодинска-Брантестам
Латвийский университет, Институт биологии; Нордический Центр по генетическим ресурсам (NordGen)
Латвия


Список литературы

1. Зеленская Е. Г., Конарев А. В., Лоскутов И. Г., Губарева Н. К., Стрельченко П. П. Характеристика старо-местных форм овса посевного (Avena sativa L.) из коллекции ВИР по полиморфизму авенина // Аграрная Россия. 2004. № 6. С. 50-58

2. Идентификация сортов и регистрация генофонда культурных растений по белкам семян /ред. Конарев В. Г. СПб.: ВИР, 2000. 186 с

3. Конарев А. В. Использование молекулярных маркеров в решении проблем генетических ресурсов растений и селекции // Аграрная Россия. 2006. № 6. С. 4-22

4. Конарев А. В., Перчук И. Н., Накаяма С. Использование полиморфизма проламинов в изучении исходного материала и семеноводстве злаковых трав // Аграрная Россия. 2002. № 3. С. 63-65

5. Конарев В. Г. Белки растений как генетические маркеры. М.: Колос, 1983. 320 с

6. Лоскутов И. Г., Губарева Н. К., Алпатьева Н. В. Полиморфизм авенина в изучении дикорастущих видов овса // Аграрная Россия. 2005. № 2. С. 43-48

7. Лоскутов И. Г., Ковалева О. Н., Блинова Е. В. Методические указания по изучению и сохранению мировой коллекции ячменя и овса. СПб.: ГНУ ВИР, 2012. 63 с

8. Плохинский Н. А. Алгоритмы биометрии. М.: МГУ, 1980. 107 с

9. Перчук И. Н., Лоскутов И. Г. Электро-форетический анализ авенина - эффективный метод мониторинга состояния коллекции овса посевного // Генетические ресурсы растений - основа продовольственной безопасности и повышения качества жизни: Тез докл. Междунар. научн. конф. С.-Петербург, 2014. С. 78.

10. Поморцев А. А., Лялина Е. В. Идентификация и оценка сортовой чистоты семян ячменя методом электрофоретического анализа запасных белков зерна. М.: МСХА, 2003. 84 с

11. Пюккенен В. П., Губарева Н. К., Митрофанова О. П. Поиск возможных дублетов среди коллекционных образцов мягкой пшеницы из Китая // Аграрная Россия. 2005. № 2. С. 31-34.

12. Романова Ю. А., Губарева Н. К., Конарев А. В., Митрофанова О. П., Ляпунова О.А., Анфилова Н. А., Стрельченко А. П. Исследование коллекции вида пшеницы Triticum spelta L. по полиморфизму глиадинов // Генетика. 2001. Т. 37. № 9. С. 1258-1265

13. Халафян А. А. Статистика 6. Статистический анализ данных. М.: Бином, 2010. 528 с

14. Bradley V., Kisha T., Jonson R. The identification of duplicate accessions within a grass germplasm collection using RAPD analysis [abstract] // Crop Sci. Soc. Am., 2002, p.131923

15. Diederichsen A. Duplication asses-sments in Nordic Avena sativa accessions at the Canadian national genebank // Gen. Res. Crop Evol., 2009, vol. 56, no. 4, pp. 587-597

16. Dobrovolskaya O., Saleh U., Malysheva-Otto L., Roder M. S., Borner A. Rationalising germplasm collections: a case study for wheat // Theor. Appl. Genet, 2005, vol. 111, pp. 1322-1329. DOI 10.1007/s00122-005-0061-9

17. Fu Y. B. Genetic variability in multiple accessions of two Canadian heritage crop cultivars as revealed by AFLP markers // Comm. Biom. Crop Sci., 2006, vol. 1, pp. 1-10.

18. Hintum van Th. J. L. Drowning in the genepool. Managing genetic diversity in genebank collections: Academic thesis for the degree of Doctor of agronomy. Swed. Univer. Agr. Sci. 1994, 360 p.

19. Hintum van T. J. L. Duplication within and between germplasm collections. III. A quantitative model // Gen. Res. Crop Evol., 2000, vol. 47, pp. 507-513.

20. Hintum van T. J. L., Knupffer H. Duplication within and between germplasm collections. I. Identifying duplication on the basis of passport data // Gen. Res. Crop Evol., 1995, vol. 42, no. 2, pp. 127-133.

21. Hintum van T. J. L., Visser D. L. Duplication within and between germplasm collections. II. Duplication in four European barleys collections // Gen. Res. Crop Evol., 1995, vol. 42, no. 2, pp. 135-145.

22. International Rules for Seed Testing. Rules 1996. Verification of species and cultivar. Seed Sci. & Technol. 1996, vol. 24 (Supplement) pp. 253-270.

23. Konarev A. V., Gubareva N. K., Kornuchin D. L., Berner A. Gliadin elecrophoretic analysis of the genetic integrity of wheat (Triticum aestivum) accessions after frequent seed reproduction // Gen. Res. Crop Evol., 2005, vol. 52, pp. 519-523

24. Konarev A. V., Vvedenskaya I. O., Nasonova E. A., Perchuk I. N. Use of prolamine poly morphism in studing genetic resources of forage grasses // Gen. Res. Crop Evol., 1995, vol. 42, pp. 197-209

25. Leonova S., Shelenga T., Hamberg M., Konarev A., Loskutov I., Carlsson A. Analysis of oil composition in cultivars and wild species of Oat (Avena sp.) // J. Agr. Food Chem., 2008, vol. 56, no. 17, pp. 7983-7991

26. Loskutov I. G., Omelchenko A. Y., Harrer S. Identification of duplicates by comparing of passport database of Avena germplasm collections. Available at http://www.ecpgr.caar. org/AGIS /Docs/ MAANov07 Paper IL.pdf, 2007

27. Lund B., Ortiz R., SkovgaardI. Analysis of potential duplicates in barly gene bank collections using re-sampling of microsatellite data // Theor. Appl. Genet., 2003, vol. 106, pp. 1129-1138.DOI 10.1007/s00122-002-1130-y

28. Lyman J. M.Progress and planning for germplasm conservation of major food crops. Plant Gen. Res. Newsletter, 1984, vol. 60, pp. 3-21

29. Molecular biological aspects of applied botany, genetics and plant breeding. Series: «Theoretical Basis of Plant Breeding», vol. I / Ed. V. G. Konarev, A. V. Konarev. St. Petersburg: VIR, 1996. 228 p

30. Portyanko V. A. , Sharopova N. R. , Sozinov A. A. Characterisation of European oat germplasm allelic variation at complex avenin loci detected by acid polyacrylamide gel electrophoresis // Euphytica, 1998, vol. 102, pp. 15-27/

31. Ruiz M., Aguiriano E. Analysis of duplication in the Spanish durum wheat collection maintained in the CRF-INIA on the basis of agro-morphological traits and gliadin proteins // Gen. Res. Crop. Evol., 2004, vol. 51, pp. 231-235/

32. Sahu R. K. Screening for duplicates in the germplasm collections // Int. Rice Res. Newslett., 1989, vol. 14, p. 4

33. The state of the world’s plant genetic resources for food and agriculture. Food and Agriculture Organization of the United Nations. Rome, 1998, 510 p

34. Verma S. K. , Khanna V. K. , Singh N. K. Random amplified polymorphic DNA analysis of Indian scented basmati rice (Oryza sativa L.) germplasm for identification of variability and duplicate accessions, if any // Electrophoresis, 1999, vol. 20, pp. 1786-1789

35. Virk P. S., Newbury H. J., Jacson M. T., Ford-Lloyd B. V. The identification of duplicate accessions within a rice germplasm collection using RAPD analysis // Theor. Appl. Genet., 1995, vol. 90, pp. 1049-1055

36. Willner E., Sackville Hamilton N.R., Knupffer H. Duplication in forages collections // Report of a Working Group on Forages. 6 th Meeting. 6-8 March. 1997. Beitostolen. Norway. / Ed. Maggioni L., Marum P., Sackville Hamilton N. R, Thomas I., Gass T., Lipman E. Rome. Italy: Int. Plant Gen. Res. Ins., 1998, pp. 92-95

37. Yndgaard F., Loskutov I., Solberg S., Kovaleva O. , Agnese K. Brantestam and T. Svensson J. T. A low-cost method for the evaluation of potential duplicate holdings of genebank accessions [In press]


Для цитирования:


Перчук И.Н., Конарев А.В., Лоскутов И.Г., Блинова Е.В., Новикова Л.Ю., Хорева В.И., Колодинска-Брантестам А... БЕЛКОВЫЕ МАРКЕРЫ, МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ И СЕЛЕКЦИОННЫЕ ПРИЗНАКИ В ИДЕНТИФИКАЦИИ ДУБЛЕТНЫХ ОБРАЗЦОВ КУЛЬТУРНОГО ОВСА В КОЛЛЕКЦИЯХ ВИР (РОССИЯ) И НОРДИЧЕСКОГО ГЕННОГО БАНКА (NORDGEN, ШВЕЦИЯ). Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. 2016;177(3):82-93. https://doi.org/10.30901/2227-8834-2016-3-82-93

For citation:


Perchuk I.N., Konarev A.V., Loskutov I.G., Blinova E.V., Novikova L.Y., Horeva V.I., Kolodinska-Brantestam A... PROTEIN MARKERS, MORPHOLOGICAL AND BREEDING-ORIENTED CHARACTERS IN DUPLICATE ACCESSION IDENTIFICATION IN THE VIR (RUSSIA) AND NORDGEN (SWEDEN) CULTIVATED OAT COLLECTIONS. Proceedings on applied botany, genetics and breeding. 2016;177(3):82-93. (In Russ.) https://doi.org/10.30901/2227-8834-2016-3-82-93

Просмотров: 57


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2227-8834 (Print)
ISSN 2619-0982 (Online)