vir-nwТруды по прикладной ботанике, генетике и селекцииProceedings on applied botany, genetics and breeding2227-88342619-0982N.I. Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources10.30901/2227-8834-2016-3-82-93vir-nw-94Research ArticleИДЕНТИФИКАЦИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ КУЛЬТУРНЫХ РАСТЕНИЙ И ИХ ДИКИХ РОДИЧЕЙ ДЛЯ РЕШЕНИЯ ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПРИКЛАДНЫХ ПРОБЛЕМIDENTIFICATION OF THE DIVERSITY OF CULTIVATED PLANTS AND THEIR WILD RELATIVES FOR SOLVING FUNDAMENTAL AND APPLIED PROBLEMSБЕЛКОВЫЕ МАРКЕРЫ, МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ И СЕЛЕКЦИОННЫЕ ПРИЗНАКИ В ИДЕНТИФИКАЦИИ ДУБЛЕТНЫХ ОБРАЗЦОВ КУЛЬТУРНОГО ОВСА В КОЛЛЕКЦИЯХ ВИР (РОССИЯ) И НОРДИЧЕСКОГО ГЕННОГО БАНКА (NORDGEN, ШВЕЦИЯ)PROTEIN MARKERS, MORPHOLOGICAL AND BREEDING-ORIENTED CHARACTERS IN DUPLICATE ACCESSION IDENTIFICATION IN THE VIR (RUSSIA) AND NORDGEN (SWEDEN) CULTIVATED OAT COLLECTIONSПерчукИ. Н.PerchukI. N.i.perchuk@vir.nw.ruКонаревА. В.KonarevA. V.noemail@neicon.ruЛоскутовИ. Г.LoskutovI. G.i.loskutov@vir.nw.ruБлиноваЕ. В.BlinovaE. V.e.blinova@vir.nw.ruНовиковаЛ. Ю.NovikovaL. Y.l.novikova@vir.nw.ruХореваВ. И.HorevaV. I.noemail@neicon.ruКолодинска-БрантестамА. .Kolodinska-BrantestamA. .noemail@neicon.ruФедеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. ВавиловаРоссияFederal Research Center the N.I.Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources (VIR)Russian FederationФедеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова; Санкт-Петербургский государственный университет (СПбГУ)РоссияFederal Research Center the N.I.Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources (VIR); Saint Petersburg State UniversityRussian FederationЛатвийский университет, Институт биологии; Нордический Центр по генетическим ресурсам (NordGen)ЛатвияUniversity of Latvia, Institute of Biology; Nordic Genetic Resource Center (NordGen)Latvia20161706201817738293Copyright © Перчук И.Н., Конарев А.В., Лоскутов И.Г., Блинова Е.В., Новикова Л.Ю., Хорева В.И., Колодинска-Брантестам А..., 20182018Перчук И.Н., Конарев А.В., Лоскутов И.Г., Блинова Е.В., Новикова Л.Ю., Хорева В.И., Колодинска-Брантестам А...Perchuk I.N., Konarev A.V., Loskutov I.G., Blinova E.V., Novikova L.Y., Horeva V.I., Kolodinska-Brantestam A...Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://elpub.vir.nw.ru/jour/article/view/94

Обсуждаются методы идентификации дублетов в коллекциях генбанков и само понятие «дублетный образец». Представлены результаты сравнительного полевого и лабораторного анализа 112 пар потенциальных дублетных образцов овса из коллекций ВИР и NordGen. Установленное соответствие результатов полевого и лабораторного изучения подтверждает возможность использования электрофоретических спектров авенина для идентификации дублетных образцов в коллекциях овса посевного еще до полевых испытаний или в случае потери всхожести семян анализируемых образцов.

Methods for identification of duplicate accessions in genebanks and the term “duplicate accession” are discussed. The results of comparative field and laboratory analysis of 112 pairs of potential duplicate accessions from the oat collections of VIR and NordGen are presented. The revealed conformity between the results of the field and laboratory tests proves the use of avenin electrophoretic banding patterns for duplicate identification in the oat collections before field testing or in case of loss of germination in the seeds of the tested accessions.

сорта овса посевногодублетные образцыбелковые маркерыэлектрофорез авенинаcultivated oat varietiesduplicate accessionsprotein markersavenin electrophoresisReferencesЗеленская Е. Г., Конарев А. В., Лоскутов И. Г., Губарева Н. К., Стрельченко П. П. Характеристика старо-местных форм овса посевного (Avena sativa L.) из коллекции ВИР по полиморфизму авенина // Аграрная Россия. 2004. № 6. С. 50-58Зеленская Е. Г., Конарев А. В., Лоскутов И. Г., Губарева Н. К., Стрельченко П. П. Характеристика старо-местных форм овса посевного (Avena sativa L.) из коллекции ВИР по полиморфизму авенина // Аграрная Россия. 2004. № 6. С. 50-58Идентификация сортов и регистрация генофонда культурных растений по белкам семян /ред. Конарев В. Г. СПб.: ВИР, 2000. 186 сИдентификация сортов и регистрация генофонда культурных растений по белкам семян /ред. Конарев В. Г. СПб.: ВИР, 2000. 186 сКонарев А. В. Использование молекулярных маркеров в решении проблем генетических ресурсов растений и селекции // Аграрная Россия. 2006. № 6. С. 4-22Конарев А. В. Использование молекулярных маркеров в решении проблем генетических ресурсов растений и селекции // Аграрная Россия. 2006. № 6. С. 4-22Конарев А. В., Перчук И. Н., Накаяма С. Использование полиморфизма проламинов в изучении исходного материала и семеноводстве злаковых трав // Аграрная Россия. 2002. № 3. С. 63-65Конарев А. В., Перчук И. Н., Накаяма С. Использование полиморфизма проламинов в изучении исходного материала и семеноводстве злаковых трав // Аграрная Россия. 2002. № 3. С. 63-65Конарев В. Г. Белки растений как генетические маркеры. М.: Колос, 1983. 320 сКонарев В. Г. Белки растений как генетические маркеры. М.: Колос, 1983. 320 сЛоскутов И. Г., Губарева Н. К., Алпатьева Н. В. Полиморфизм авенина в изучении дикорастущих видов овса // Аграрная Россия. 2005. № 2. С. 43-48Лоскутов И. Г., Губарева Н. К., Алпатьева Н. В. Полиморфизм авенина в изучении дикорастущих видов овса // Аграрная Россия. 2005. № 2. С. 43-48Лоскутов И. Г., Ковалева О. Н., Блинова Е. В. Методические указания по изучению и сохранению мировой коллекции ячменя и овса. СПб.: ГНУ ВИР, 2012. 63 сЛоскутов И. Г., Ковалева О. Н., Блинова Е. В. Методические указания по изучению и сохранению мировой коллекции ячменя и овса. СПб.: ГНУ ВИР, 2012. 63 сПлохинский Н. А. Алгоритмы биометрии. М.: МГУ, 1980. 107 сПлохинский Н. А. Алгоритмы биометрии. М.: МГУ, 1980. 107 сПерчук И. Н., Лоскутов И. Г. Электро-форетический анализ авенина - эффективный метод мониторинга состояния коллекции овса посевного // Генетические ресурсы растений - основа продовольственной безопасности и повышения качества жизни: Тез докл. Междунар. научн. конф. С.-Петербург, 2014. С. 78.Перчук И. Н., Лоскутов И. Г. Электро-форетический анализ авенина - эффективный метод мониторинга состояния коллекции овса посевного // Генетические ресурсы растений - основа продовольственной безопасности и повышения качества жизни: Тез докл. Междунар. научн. конф. С.-Петербург, 2014. С. 78.Поморцев А. А., Лялина Е. В. Идентификация и оценка сортовой чистоты семян ячменя методом электрофоретического анализа запасных белков зерна. М.: МСХА, 2003. 84 сПоморцев А. А., Лялина Е. В. Идентификация и оценка сортовой чистоты семян ячменя методом электрофоретического анализа запасных белков зерна. М.: МСХА, 2003. 84 сПюккенен В. П., Губарева Н. К., Митрофанова О. П. Поиск возможных дублетов среди коллекционных образцов мягкой пшеницы из Китая // Аграрная Россия. 2005. № 2. С. 31-34.Пюккенен В. П., Губарева Н. К., Митрофанова О. П. Поиск возможных дублетов среди коллекционных образцов мягкой пшеницы из Китая // Аграрная Россия. 2005. № 2. С. 31-34.Романова Ю. А., Губарева Н. К., Конарев А. В., Митрофанова О. П., Ляпунова О.А., Анфилова Н. А., Стрельченко А. П. Исследование коллекции вида пшеницы Triticum spelta L. по полиморфизму глиадинов // Генетика. 2001. Т. 37. № 9. С. 1258-1265Романова Ю. А., Губарева Н. К., Конарев А. В., Митрофанова О. П., Ляпунова О.А., Анфилова Н. А., Стрельченко А. П. Исследование коллекции вида пшеницы Triticum spelta L. по полиморфизму глиадинов // Генетика. 2001. Т. 37. № 9. С. 1258-1265Халафян А. А. Статистика 6. Статистический анализ данных. М.: Бином, 2010. 528 сХалафян А. А. Статистика 6. Статистический анализ данных. М.: Бином, 2010. 528 сBradley V., Kisha T., Jonson R. The identification of duplicate accessions within a grass germplasm collection using RAPD analysis [abstract] // Crop Sci. Soc. Am., 2002, p.131923Bradley V., Kisha T., Jonson R. The identification of duplicate accessions within a grass germplasm collection using RAPD analysis [abstract] // Crop Sci. Soc. Am., 2002, p.131923Diederichsen A. Duplication asses-sments in Nordic Avena sativa accessions at the Canadian national genebank // Gen. Res. Crop Evol., 2009, vol. 56, no. 4, pp. 587-597Diederichsen A. Duplication asses-sments in Nordic Avena sativa accessions at the Canadian national genebank // Gen. Res. Crop Evol., 2009, vol. 56, no. 4, pp. 587-597Dobrovolskaya O., Saleh U., Malysheva-Otto L., Roder M. S., Borner A. Rationalising germplasm collections: a case study for wheat // Theor. Appl. Genet, 2005, vol. 111, pp. 1322-1329. DOI 10.1007/s00122-005-0061-9Dobrovolskaya O., Saleh U., Malysheva-Otto L., Roder M. S., Borner A. Rationalising germplasm collections: a case study for wheat // Theor. Appl. Genet, 2005, vol. 111, pp. 1322-1329. DOI 10.1007/s00122-005-0061-9Fu Y. B. Genetic variability in multiple accessions of two Canadian heritage crop cultivars as revealed by AFLP markers // Comm. Biom. Crop Sci., 2006, vol. 1, pp. 1-10.Fu Y. B. Genetic variability in multiple accessions of two Canadian heritage crop cultivars as revealed by AFLP markers // Comm. Biom. Crop Sci., 2006, vol. 1, pp. 1-10.Hintum van Th. J. L. Drowning in the genepool. Managing genetic diversity in genebank collections: Academic thesis for the degree of Doctor of agronomy. Swed. Univer. Agr. Sci. 1994, 360 p.Hintum van Th. J. L. Drowning in the genepool. Managing genetic diversity in genebank collections: Academic thesis for the degree of Doctor of agronomy. Swed. Univer. Agr. Sci. 1994, 360 p.Hintum van T. J. L. Duplication within and between germplasm collections. III. A quantitative model // Gen. Res. Crop Evol., 2000, vol. 47, pp. 507-513.Hintum van T. J. L. Duplication within and between germplasm collections. III. A quantitative model // Gen. Res. Crop Evol., 2000, vol. 47, pp. 507-513.Hintum van T. J. L., Knupffer H. Duplication within and between germplasm collections. I. Identifying duplication on the basis of passport data // Gen. Res. Crop Evol., 1995, vol. 42, no. 2, pp. 127-133.Hintum van T. J. L., Knupffer H. Duplication within and between germplasm collections. I. Identifying duplication on the basis of passport data // Gen. Res. Crop Evol., 1995, vol. 42, no. 2, pp. 127-133.Hintum van T. J. L., Visser D. L. Duplication within and between germplasm collections. II. Duplication in four European barleys collections // Gen. Res. Crop Evol., 1995, vol. 42, no. 2, pp. 135-145.Hintum van T. J. L., Visser D. L. Duplication within and between germplasm collections. II. Duplication in four European barleys collections // Gen. Res. Crop Evol., 1995, vol. 42, no. 2, pp. 135-145.International Rules for Seed Testing. Rules 1996. Verification of species and cultivar. Seed Sci. & Technol. 1996, vol. 24 (Supplement) pp. 253-270.International Rules for Seed Testing. Rules 1996. Verification of species and cultivar. Seed Sci. & Technol. 1996, vol. 24 (Supplement) pp. 253-270.Konarev A. V., Gubareva N. K., Kornuchin D. L., Berner A. Gliadin elecrophoretic analysis of the genetic integrity of wheat (Triticum aestivum) accessions after frequent seed reproduction // Gen. Res. Crop Evol., 2005, vol. 52, pp. 519-523Konarev A. V., Gubareva N. K., Kornuchin D. L., Berner A. Gliadin elecrophoretic analysis of the genetic integrity of wheat (Triticum aestivum) accessions after frequent seed reproduction // Gen. Res. Crop Evol., 2005, vol. 52, pp. 519-523Konarev A. V., Vvedenskaya I. O., Nasonova E. A., Perchuk I. N. Use of prolamine poly morphism in studing genetic resources of forage grasses // Gen. Res. Crop Evol., 1995, vol. 42, pp. 197-209Konarev A. V., Vvedenskaya I. O., Nasonova E. A., Perchuk I. N. Use of prolamine poly morphism in studing genetic resources of forage grasses // Gen. Res. Crop Evol., 1995, vol. 42, pp. 197-209Leonova S., Shelenga T., Hamberg M., Konarev A., Loskutov I., Carlsson A. Analysis of oil composition in cultivars and wild species of Oat (Avena sp.) // J. Agr. Food Chem., 2008, vol. 56, no. 17, pp. 7983-7991Leonova S., Shelenga T., Hamberg M., Konarev A., Loskutov I., Carlsson A. Analysis of oil composition in cultivars and wild species of Oat (Avena sp.) // J. Agr. Food Chem., 2008, vol. 56, no. 17, pp. 7983-7991Loskutov I. G., Omelchenko A. Y., Harrer S. Identification of duplicates by comparing of passport database of Avena germplasm collections. Available at http://www.ecpgr.caar. org/AGIS /Docs/ MAANov07 Paper IL.pdf, 2007Loskutov I. G., Omelchenko A. Y., Harrer S. Identification of duplicates by comparing of passport database of Avena germplasm collections. Available at http://www.ecpgr.caar. org/AGIS /Docs/ MAANov07 Paper IL.pdf, 2007Lund B., Ortiz R., SkovgaardI. Analysis of potential duplicates in barly gene bank collections using re-sampling of microsatellite data // Theor. Appl. Genet., 2003, vol. 106, pp. 1129-1138.DOI 10.1007/s00122-002-1130-yLund B., Ortiz R., SkovgaardI. Analysis of potential duplicates in barly gene bank collections using re-sampling of microsatellite data // Theor. Appl. Genet., 2003, vol. 106, pp. 1129-1138.DOI 10.1007/s00122-002-1130-yLyman J. M.Progress and planning for germplasm conservation of major food crops. Plant Gen. Res. Newsletter, 1984, vol. 60, pp. 3-21Lyman J. M.Progress and planning for germplasm conservation of major food crops. Plant Gen. Res. Newsletter, 1984, vol. 60, pp. 3-21Molecular biological aspects of applied botany, genetics and plant breeding. Series: «Theoretical Basis of Plant Breeding», vol. I / Ed. V. G. Konarev, A. V. Konarev. St. Petersburg: VIR, 1996. 228 pMolecular biological aspects of applied botany, genetics and plant breeding. Series: «Theoretical Basis of Plant Breeding», vol. I / Ed. V. G. Konarev, A. V. Konarev. St. Petersburg: VIR, 1996. 228 pPortyanko V. A. , Sharopova N. R. , Sozinov A. A. Characterisation of European oat germplasm allelic variation at complex avenin loci detected by acid polyacrylamide gel electrophoresis // Euphytica, 1998, vol. 102, pp. 15-27/Portyanko V. A. , Sharopova N. R. , Sozinov A. A. Characterisation of European oat germplasm allelic variation at complex avenin loci detected by acid polyacrylamide gel electrophoresis // Euphytica, 1998, vol. 102, pp. 15-27/Ruiz M., Aguiriano E. Analysis of duplication in the Spanish durum wheat collection maintained in the CRF-INIA on the basis of agro-morphological traits and gliadin proteins // Gen. Res. Crop. Evol., 2004, vol. 51, pp. 231-235/Ruiz M., Aguiriano E. Analysis of duplication in the Spanish durum wheat collection maintained in the CRF-INIA on the basis of agro-morphological traits and gliadin proteins // Gen. Res. Crop. Evol., 2004, vol. 51, pp. 231-235/Sahu R. K. Screening for duplicates in the germplasm collections // Int. Rice Res. Newslett., 1989, vol. 14, p. 4Sahu R. K. Screening for duplicates in the germplasm collections // Int. Rice Res. Newslett., 1989, vol. 14, p. 4The state of the world’s plant genetic resources for food and agriculture. Food and Agriculture Organization of the United Nations. Rome, 1998, 510 pThe state of the world’s plant genetic resources for food and agriculture. Food and Agriculture Organization of the United Nations. Rome, 1998, 510 pVerma S. K. , Khanna V. K. , Singh N. K. Random amplified polymorphic DNA analysis of Indian scented basmati rice (Oryza sativa L.) germplasm for identification of variability and duplicate accessions, if any // Electrophoresis, 1999, vol. 20, pp. 1786-1789Verma S. K. , Khanna V. K. , Singh N. K. Random amplified polymorphic DNA analysis of Indian scented basmati rice (Oryza sativa L.) germplasm for identification of variability and duplicate accessions, if any // Electrophoresis, 1999, vol. 20, pp. 1786-1789Virk P. S., Newbury H. J., Jacson M. T., Ford-Lloyd B. V. The identification of duplicate accessions within a rice germplasm collection using RAPD analysis // Theor. Appl. Genet., 1995, vol. 90, pp. 1049-1055Virk P. S., Newbury H. J., Jacson M. T., Ford-Lloyd B. V. The identification of duplicate accessions within a rice germplasm collection using RAPD analysis // Theor. Appl. Genet., 1995, vol. 90, pp. 1049-1055Willner E., Sackville Hamilton N.R., Knupffer H. Duplication in forages collections // Report of a Working Group on Forages. 6 th Meeting. 6-8 March. 1997. Beitostolen. Norway. / Ed. Maggioni L., Marum P., Sackville Hamilton N. R, Thomas I., Gass T., Lipman E. Rome. Italy: Int. Plant Gen. Res. Ins., 1998, pp. 92-95Willner E., Sackville Hamilton N.R., Knupffer H. Duplication in forages collections // Report of a Working Group on Forages. 6 th Meeting. 6-8 March. 1997. Beitostolen. Norway. / Ed. Maggioni L., Marum P., Sackville Hamilton N. R, Thomas I., Gass T., Lipman E. Rome. Italy: Int. Plant Gen. Res. Ins., 1998, pp. 92-95Yndgaard F., Loskutov I., Solberg S., Kovaleva O. , Agnese K. Brantestam and T. Svensson J. T. A low-cost method for the evaluation of potential duplicate holdings of genebank accessions [In press]Yndgaard F., Loskutov I., Solberg S., Kovaleva O. , Agnese K. Brantestam and T. Svensson J. T. A low-cost method for the evaluation of potential duplicate holdings of genebank accessions [In press]

The authors declare that there are no conflicts of interest present.