<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">vir-nw</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Proceedings on applied botany, genetics and breeding</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2227-8834</issn><issn pub-type="epub">2619-0982</issn><publisher><publisher-name>N.I. Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.30901/2227-8834-2019-3-63-70</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">vir-nw-420</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ГЕНЕТИКА КУЛЬТУРНЫХ РАСТЕНИЙ И ИХ ДИКИХ РОДИЧЕЙ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>GENETICS OF CULTIVATED PLANTS AND THEIR WILD RELATIVES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ КОЛЛЕКЦИИ СОРТОВ И ГИБРИДНЫХ ФОРМ ТОМАТА ПО УСТОЙЧИВОСТИ К КЛАДОСПОРИОЗУ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ДНК-МАРКЕРОВ</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>ANALYSIS OF A GENETIC COLLECTION OF TOMATO CULTIVARS AND HYBRID FORMS FOR RESISTANCE TO LEAF MOLD USING DNA MARKERS</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Шамшин</surname><given-names>И. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Shamshin</surname><given-names>I. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>393760 Тамбовская обл., г. Мичуринск, ул. Интернациональная, 101</p></bio><bio xml:lang="en"><p>101 Internatsionalnaya St., Michurinsk, Tambov Province 393760</p></bio><email xlink:type="simple">ivan_shamshin@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Маслова</surname><given-names>М. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Maslova</surname><given-names>M. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>393760 Тамбовская обл., г. Мичуринск, ул. Интернациональная, 101</p></bio><bio xml:lang="en"><p>101 Internatsionalnaya St., Michurinsk, Tambov Province 393760</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Грязнева</surname><given-names>Ю. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Gryazneva</surname><given-names>Y. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>393760 Тамбовская обл., г. Мичуринск, ул. Интернациональная, 101</p></bio><bio xml:lang="en"><p>101 Internatsionalnaya St., Michurinsk, Tambov Province 393760</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>Мичуринский государственный аграрный университет</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Michurinsk State Agrarian University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2019</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>29</day><month>10</month><year>2019</year></pub-date><volume>180</volume><issue>3</issue><fpage>63</fpage><lpage>70</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Шамшин И.Н., Маслова М.В., Грязнева Ю.В., 2019</copyright-statement><copyright-year>2019</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Шамшин И.Н., Маслова М.В., Грязнева Ю.В.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Shamshin I.N., Maslova M.V., Gryazneva Y.V.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://elpub.vir.nw.ru/jour/article/view/420">https://elpub.vir.nw.ru/jour/article/view/420</self-uri><abstract><sec><title>Актуальность</title><p>Актуальность. Одной из наиболее вредоносных болез­ней томата является кладоспориоз, вызываемый грибом Cladosporium fulvum Cooke. Надежным и экологически безопасным способом защиты томата от болезней явля­ется создание устойчивых сортов и гибридов. В основе данного метода лежит изучение генетических аспектов устойчивости растений к патогенам. Маркерный отбор исходных форм томата – сравнительно новый подход в селекции, основанный на прямом отборе растений по генам, определяющим хозяйственно ценные признаки. Он позволяет проводить анализ селекционного материа­ла в короткие сроки.</p></sec><sec><title>Материалы и методы</title><p>Материалы и методы. В представ­ленной работе изложены результаты скрининга более 30 образцов генетической коллекции сортов и гибридов томата Мичуринского ГАУ с использованием молекуляр­ного маркера Р7.</p></sec><sec><title>Результаты и обсуждение</title><p>Результаты и обсуждение. Оценен по­лиморфизм гена устойчивости к кладоспориозу Cf-19. Получены четкие, воспроизводимые результаты. Для те­стирования маркера были использованы семь гибрид­ных форм томата закрытого грунта. Подтверждение над­ежности выявления гена Cf-19 с помощью маркера P7 проводили путем искусственного заражения грибом C. fulvum. При этом шесть гибридов из семи показали вы­сокий уровень устойчивости к патогену, что подтвержда­ется данными оригинаторов. Сильное поражение отме­чено на листьях только одного гибрида. На основании молекулярно-генетического анализа установлено, что из всех контрольных образцов, только данный генотип яв­ляется рецессивной гомозиготой . Кроме того, по данным оригинатора, он не обладает устойчивостью к кладоспо­риозу. Проведенный эксперимент доказывает высокую эффективность маркера Р7. С его использованием было проанализировано 35 генотипов. Полученные в ходе ра­боты данные показывают, что большинство исследуе­мых образцов оказались гетерозиготными. Однако отме­чены и гомозиготные формы. Так, сорт томата ‘Золотой дождь’ имеет только один фрагмент размером 250 пн, что соответствует рецессивной гомозиготе. У четырех ге­нотипов выявлен фрагмент размером 300 пн, что соот­ветствует доминантной гомозиготе. Проведенный моле­кулярно-генетический анализ позволил выявить ряд ге­нотипов, которые рекомендованы в качестве источников устойчивости к кладоспориозу.  </p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>Background</title><p>Background. Leaf mold, a disease caused by the fungus Cladosporium fulvum Cooke in tomato, is one of the reasons for a significant decrease in the fruit yield. The most reli­able and environmentally friendly way to protect tomato from diseases is the development of resistant cultivars and hybrids. The study of genetic aspects of disease resistance in plants is the basis of successful breeding work. Marker-assisted selection of the source forms of tomato is a rela­tively new approach in breeding, based on direct selection of plants for genes that determine the economically impor­tant traits. It allows for the time-saving analysis of breed­ing material.</p></sec><sec><title>Materials and methods</title><p>Materials and methods. The present work offers the results of screening more than 30 accessions from the genetic collection of tomato cultivars and hybrids of the Michurinsk State Agrarian University using the P7 molecular marker.</p></sec><sec><title>Results and discussion</title><p>Results and discussion. Polymor­phism of the Cf-19 gene of resistance to leaf mold was evalu­ated, and clear reproducible results were obtained. To test the marker, seven hybrid forms of greenhouse tomato were used. The reliable identification of the Cf-19 gene by using the P7 marker was confirmed through artificial infection with C. fulvum. Six out of seven hybrids demonstrated a high level of resistance to the pathogen, which is con­firmed by the originators’ data. A strong lesion was noted on the leaves of only one hybrid. The molecular genetic analysis has shown that among all control samples, only this genotype was a recessive homozygote. Besides, ac­cording to the originator, this genotype is not resistant to leaf mold. The performed test proves the high efficiency of the P7 marker. By using it, 35 genotypes were analyzed. The data obtained during the work show that the majority of the studied samples turned out to be heterozygous. At the same time, homozygous forms were also noted. For in­stance, the ‘Golden Rain’ tomato cultivar has only one 250 bp fragment, which corresponds to a recessive homo­zygote. Four genotypes were found to contain 300 bp frag­ments, which correspond to dominant homozygotes. The molecular genetic analysis revealed a number of genotypes that can be used as sources of resistance to leaf mold.  </p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>селекция</kwd><kwd>гены устойчивости</kwd><kwd>Cladosporium fulvum Cooke</kwd><kwd>молекулярные маркеры</kwd><kwd>ПЦР</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>breeding</kwd><kwd>genes of resistance to Cladosporium fulvum Cooke</kwd><kwd>molecular markers</kwd><kwd>PCR</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">De Wit P.J.G.M., Joosten M.H.A.J. Avirulence and resistance genes in the Cladosporium fulvum–tomato interaction. Curr Opin Microb. 1999;2(4):368-373. DOI: 10.1016/S1369-5274(99)80065-4</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">De Wit P.J.G.M., Joosten M.H.A.J. Avirulence and resistance genes in the Cladosporium fulvum–tomato interaction. Curr Opin Microb. 1999;2(4):368-373. DOI: 10.1016/S1369-5274(99)80065-4</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Doyle J.J., Doyle J.L. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus. 1990;12(1):13-15.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Doyle J.J., Doyle J.L. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus. 1990;12(1):13-15.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Hammond-Kosack K.E., Jones J.D. Resistance gene-dependent plant defense responses. Plant Cell. 1996;8(10):1773-1791.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Hammond-Kosack K.E., Jones J.D. Resistance gene-dependent plant defense responses. Plant Cell. 1996;8(10):1773-1791.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Подвицкий Т.А., Галиновский Д.В., Тарутина Л.А. Источники устойчивости томатов (род Lycopersicon) к возбудителям хозяйственно значимых заболеваний. Известия национальной академии наук Беларуси. 2013;(4):45-49.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Padvitski T.A., Galinousky D.V., Tarutina L.A. Source of tomato (genus Lycopersicon) resistance to agent of eco¬nomically significant diseases (Istochniki ustoychivosti tomatov (rod Lycopersicon) k vozbuditelyam khozyay-stvenno znachimykh zabolevaniy). Proceedings of the National Academy of Sciences of Belarus. 2013;(4):45-49. [in Russian]</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Pnueli L., Carmel-Goren L., Hareven D., Gutfinger T., Alvarez J., Ganal M. et al. The SELF-PRUNING gene of tomato regulates vegetative to reproductive switching of sympodial meristems and is the ortholog of CEN and TFL1. Development. 1998;125(11):1979-1989.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Pnueli L., Carmel-Goren L., Hareven D., Gutfinger T., Alvarez J., Ganal M. et al. The SELF-PRUNING gene of tomato regulates vegetative to reproductive switching of sympodial meristems and is the ortholog of CEN and TFL1. Development. 1998;125(11):1979-1989.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Поликсенова В.Д. Биоразнообразие в патосистеме “Lycopersicon (Tourn.) Mill. – Cladosporium fulvum Cooke” / Достижения современной биологии и биологическое образование. Труды 2-й Международной научно-практической конференции. Минск; 2002. С.105-109). URL: http://www.bio.bsu.by/botany/files/pub_polik2002a.pdf [дата обращения 15.02.2019].</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Poliksenova V.D. Biodiversity in the pathosystem ‘Lycopersicon (Tourn.) Mill. – Cladosporium fulvum Cooke’ (Bioraznoobraziye v patosisteme “Lycopersicon (Tourn.) Mill. – Cladosporium fulvum Cooke”). In: Proceedings of the 2nd International Scientific &amp; Practical Conference: Achievements of Modern Biology and Biological Education (Dostizheniya sovremennoy biologii i bio¬logicheskoye obrazovaniye). Minsk; 2002. p.105-109. [in Russian] URL: http://www.bio.bsu.by/botany/files/pub_polik2002a.pdf [accessed on 15.02.2019].</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Robbins M.D., Masud M.A., Panthee D.R., Gardner R.G., Francis D.M., Stevens M.R. Marker-assisted selection for coupling phase resistance to tomato spotted wilt virus and Phytophthora infestans (late blight) in tomato. HortScience. 2010;45(10):1424-1428. DOI: 10.21273/HORTSCI.45.10.1424</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Robbins M.D., Masud M.A., Panthee D.R., Gardner R.G., Francis D.M., Stevens M.R. Marker-assisted selection for coupling phase resistance to tomato spotted wilt virus and Phytophthora infestans (late blight) in tomato. HortScience. 2010;45(10):1424-1428. DOI: 10.21273/HORTSCI.45.10.1424</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Шамшин И.Н., Кудрявцев А.М., Савельев Н.И. Создание генетических паспортов сортов яблони на основе анализа полиморфизма микросателлитных локусов генома: методика. Мичуринск; 2013).</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shamshin I.N., Kudryavtsev A.M., Saveliev N.I. Creation of genetic passports of apple varieties based on the analysis of the polymorphism of microsatellite genome loci: Guidelines (Sozdaniye geneticheskikh pasportov sor¬tov yabloni na osnove analiza polimorfizma mikros¬atellitnykh lokusov genoma: metodika). Michurinsk; 2013. [in Russian]</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Терешонкова Т.А., Огнев В.В., Прохорова К.Г., Костенко А.Н., Ховрин А.Н. Отечественные гибриды томата для юга России. Картофель и овощи. 2016;(4):38-40.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Tereshonkova T.A., Ognev V.V., Prokhorova K.G., Kostenko A.N., Khovrin A.N. Domestic tomato hybrids for South of Russia (Otechestvennyye gibridy tomata dlya yuga Rossii). Kartofel i ovoshchi – Potatoes and Vegetables. 2016;(4):38-40. [in Russian]</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Wang A., Meng F., Xu X., Wang Y., Li J. Development of molecular markers linked to Cladosporium fulvum resistant gene Cf-6 in tomato by RAPD and SSR methods. HortScience. 2007;42(1);11-15. DOI: 10.21273/HORTSCI.42.1.11</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Wang A., Meng F., Xu X., Wang Y., Li J. Development of molecu¬lar markers linked to Cladosporium fulvum resistant gene Cf-6 in tomato by RAPD and SSR methods. HortScience. 2007;42(1);11-15. DOI: 10.21273/HORTSCI.42.1.11</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Zhao T., Jiang J., Liu G., He S., Zhang H., Chen X, Xu X. Mapping and candidate gene screening of tomato Cladosporium fulvum-resistant gene Cf-19, based on high-throughput sequencing technology. BMC Plant Biol. 2016;16:51. DOI: 10.1186/s12870-016-0737-0</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Zhao T., Jiang J., Liu G., He S., Zhang H., Chen X, Xu X. Mapping and candidate gene screening of tomato Cladosporium fulvum-resistant gene Cf-19, based on high-throughput sequencing technology. BMC Plant Biol. 2016;16:51. DOI: 10.1186/s12870-016-0737-0</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
